Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms