Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms