Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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