Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms