Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms