Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms