Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U595 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U595 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U595 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U595 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U595 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Q3U595 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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