Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms