Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms