Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otx2P80206 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms