Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad50P70388 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms