Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms