Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms