Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms