Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms