Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Defb1P56386 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Defb1P56386 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms