Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PtpreP49446 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpreP49446 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PtpreP49446 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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