Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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