Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms