Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprmP28828 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprmP28828 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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