Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms