Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18528 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18528 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms