Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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