Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms