Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1bP0C7A0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms