Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms