Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia4B8QI36 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms