Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms