Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprfA2A8L5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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