Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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