Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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