Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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