Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmco5aQ9D9D5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms