Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms