Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rasgef1cQ9D300 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rasgef1cQ9D300 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms