Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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