Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms