Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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