Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Abcf3Q8K268 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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