Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FgbQ8K0E8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FgbQ8K0E8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FgbQ8K0E8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FgbQ8K0E8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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