Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lin52Q8CD94 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lin52Q8CD94 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lin52Q8CD94 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lin52Q8CD94 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Lin52Q8CD94 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Lin52Q8CD94 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Lin52Q8CD94 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Lin52Q8CD94 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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