Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms