Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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