Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SkiQ60698 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms