Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm29609Q3UU56 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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