Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms