Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms