Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms