Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Taf1aP97357 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Taf1aP97357 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Taf1aP97357 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Taf1aP97357 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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