Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hoxd13P70217 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hoxd13P70217 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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